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14年,人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃干了哪些事兒
  • 發(fā)布日期:2018-11-02      瀏覽次數(shù):1888
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      每年約有70萬(wàn)例左右的新發(fā)肝癌病人,其中35萬(wàn)例以上在中國(guó)。中國(guó)是肝病大國(guó),同時(shí)也是肝癌大國(guó)。一直以來(lái),人類和肝病的斗爭(zhēng)不曾停歇。

      “得了肝癌不可怕,怕的是其復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移,要抑制腫瘤的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,需要對(duì)其表達(dá)的標(biāo)志蛋白分子進(jìn)行監(jiān)測(cè)和預(yù)警。如果執(zhí)行肝臟基本代謝及解毒功能的蛋白質(zhì)表達(dá)量降低,而與腫瘤侵襲遷移相關(guān)蛋白質(zhì)分子群的表達(dá)量增高,預(yù)示著患者預(yù)后較差,是術(shù)后的重點(diǎn)監(jiān)測(cè)對(duì)象。”軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院研究員姜穎說(shuō),在完成計(jì)劃“兩譜、兩圖、三庫(kù)”的科學(xué)目標(biāo)后, 研究團(tuán)隊(duì)正在做的是對(duì)肝癌等疾病進(jìn)行蛋白質(zhì)組分子分型和個(gè)性化臨床診療及干預(yù)方案的制定。

      而姜穎所說(shuō)的“計(jì)劃”,是始于2004年由我國(guó)主導(dǎo)的,美、英、法等17個(gè)國(guó)家科學(xué)家團(tuán)隊(duì)參與的“人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”。上述研究成果,近日將以論文形式刊發(fā)于期刊。

      在10月27—29日召開(kāi)的2018世界生命科學(xué)大會(huì)上,人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃亮相中國(guó)生命科學(xué)領(lǐng)域重大成果展示區(qū)。計(jì)劃目前進(jìn)展如何?我國(guó)又為何能牽頭實(shí)施這一生命科學(xué)領(lǐng)域的大科學(xué)計(jì)劃?科技日?qǐng)?bào)記者就此展開(kāi)采訪。

      解密基因組,繞不開(kāi)蛋白質(zhì)組

      說(shuō)到蛋白質(zhì)組計(jì)劃,就不得不提到人類基因組。2003年,隨著人類基因組計(jì)劃的完成,人類基因的注釋與確認(rèn)成為生命科學(xué)面臨的重要任務(wù)之一。

      “基因組和蛋白質(zhì)組的關(guān)系,好比詞典與文章、元素表與化工廠的關(guān)系。”時(shí)任人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃執(zhí)委、中科院院士賀福初說(shuō),蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要執(zhí)行者,想要解密基因組,必須先系統(tǒng)認(rèn)識(shí)蛋白質(zhì)組。

      2002年,師從遺傳學(xué)家談家楨的賀福初院士提出人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃,并提出建立蛋白質(zhì)組“兩譜、兩圖、三庫(kù)”的科學(xué)目標(biāo),得到了同行的廣泛響應(yīng)。

      “我國(guó)牽頭的人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃,作為人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的*計(jì)劃之一被優(yōu)先啟動(dòng),美國(guó)牽頭的是人類血漿蛋白質(zhì)組計(jì)劃。”姜穎自2003年博士畢業(yè)后就投身人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃,如今已是團(tuán)隊(duì)核心人物。她說(shuō),人類基因組計(jì)劃是以染色體進(jìn)行分工,人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃則以人體的組織器官進(jìn)行劃分。

      之所以我國(guó)科學(xué)家將人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃目標(biāo)聚焦于肝臟,是因?yàn)橹袊?guó)有1.5億以上的肝炎病毒攜帶者,每年死于病毒性肝炎及與病毒性肝炎相關(guān)的肝纖維化、肝硬化和肝癌的人數(shù)占世界總數(shù)半數(shù)以上,每年醫(yī)療費(fèi)用逾千億元(占國(guó)民生產(chǎn)總值的1%以上),控制肝病的發(fā)生發(fā)展和提高肝病患者的生活質(zhì)量迫在眉睫。

      該計(jì)劃通過(guò)對(duì)肝臟蛋白質(zhì)全景式、高通量和規(guī)模化的研究,解析肝臟蛋白質(zhì)在生理、病理過(guò)程中的功能意義,發(fā)現(xiàn)一批肝臟疾病的新型診斷標(biāo)志物、藥物作用靶標(biāo)和創(chuàng)新藥物,為全面提高疾病預(yù)防診治水平、降低醫(yī)療費(fèi)用提供有效手段。

      從1%跨越到30%,從參與走向

      作為開(kāi)發(fā)疾病預(yù)防診治藥物和技術(shù)的直接靶體庫(kù),人類蛋白質(zhì)組已成生物科技研發(fā)的戰(zhàn)略制高點(diǎn)。國(guó)家自然基金委、科技部“863”“973”計(jì)劃以及《國(guó)家中長(zhǎng)期科技規(guī)劃綱要》中,都對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)研究予以持續(xù)支持。

      值得關(guān)注的是,在人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃中,中國(guó)承擔(dān)其中30%的工作量。而此前,中國(guó)參與由美國(guó)領(lǐng)導(dǎo)的人類基因組計(jì)劃,僅承擔(dān)其中1%的工作任務(wù)。

      從1%到30%的跨越,意味著中國(guó)在大科學(xué)計(jì)劃中從參與走向了,背后是中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)的厚積薄發(fā)。賀福初表示,在國(guó)家大力支持下,中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)很快建立起比較完善和先進(jìn)的技術(shù)體系,涌現(xiàn)出一批的蛋白質(zhì)組學(xué)科技人才,產(chǎn)出一批具有重大影響的科技成果,較早地在上發(fā)出了自己的聲音,有了更加重要和突出的話語(yǔ)權(quán),學(xué)術(shù)影響和地位不斷提升。

      “賀福初院士敏銳意識(shí)到蛋白質(zhì)組成為戰(zhàn)略資源競(jìng)爭(zhēng)點(diǎn),如果不從源頭進(jìn)行創(chuàng)新占領(lǐng)制高點(diǎn),別人也不會(huì)跟著你的科學(xué)目標(biāo)和技術(shù)策略走。”姜穎告訴記者,人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃的實(shí)施過(guò)程中,賀福初院士一再?gòu)?qiáng)調(diào)要做“頂天立地”的科學(xué),科學(xué)價(jià)值和社會(huì)效益的原始創(chuàng)新,是中國(guó)能夠世界科技發(fā)展的重要因素之一。

      就在2010年,人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃“兩譜、兩圖、三庫(kù)”的科學(xué)目標(biāo)初步實(shí)現(xiàn)。我國(guó)科學(xué)家歷時(shí)5年多的艱辛探索,完成了人類肝臟蛋白質(zhì)組表達(dá)譜和修飾譜,繪制了蛋白質(zhì)相互作用連鎖圖和定位圖。“三庫(kù)”則是建立符合標(biāo)準(zhǔn)的肝臟標(biāo)本庫(kù)、發(fā)展規(guī)模化抗體制備技術(shù)并建立肝臟蛋白質(zhì)抗體庫(kù)和建立完整的肝臟蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)。

      數(shù)據(jù)資源共享,驅(qū)動(dòng)醫(yī)療發(fā)展

      “隨著人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃的開(kāi)展,我們的研究成果大多以論文、專著形式發(fā)表,計(jì)劃中所構(gòu)建的數(shù)據(jù)資源全部開(kāi)放、資源共享。”談及計(jì)劃的目前進(jìn)展,姜穎以“兩譜、兩圖”為例表示,2010—2015年間,研究人員將解析肝臟蛋白質(zhì)組的分辨率加深、覆蓋率擴(kuò)大,可以鑒定更多以前“抓不到”的蛋白。“以前僅能鑒定六千多個(gè)蛋白質(zhì),現(xiàn)在我們可以鑒定到肝臟中一萬(wàn)多種蛋白質(zhì)。而2015年以后,隨著蛋白質(zhì)組鑒定技術(shù)的通量化和微量化,我們有能力開(kāi)展大規(guī)模、微量臨床樣本的蛋白質(zhì)組鑒定了,與醫(yī)療的聯(lián)系也越發(fā)緊密。”

      姜穎親歷了中國(guó)蛋白質(zhì)組計(jì)劃從無(wú)到有、從跟著人家干到牽頭的全過(guò)程。讓她自豪的是,中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展可以應(yīng)用于我國(guó)重大疾病個(gè)性化治療方案的制定,這是作為基礎(chǔ)研究科研人員為欣慰的。

      “對(duì)126例肝癌及配對(duì)癌旁組織樣本的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)產(chǎn)出后,我們發(fā)現(xiàn),目前臨床上認(rèn)為的早期肝癌患者,其蛋白質(zhì)組構(gòu)成有很大不同,可以據(jù)此分成三種不同的蛋白質(zhì)組亞型,而不同亞型的患者,術(shù)后應(yīng)該對(duì)應(yīng)不同的治療方案。”姜穎說(shuō),科研人員監(jiān)測(cè)發(fā)現(xiàn),早期肝癌病人在進(jìn)行手術(shù)切除后,約30%的患者術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的危險(xiǎn)系數(shù)非常大,蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)會(huì)為病人提供相應(yīng)的候選靶向治療方案。

      十多年間,人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃交出了一份傲人的成績(jī)單:成功構(gòu)建肝臟蛋白質(zhì)組的表達(dá)譜、修飾譜、連鎖圖及其綜合數(shù)據(jù)庫(kù);實(shí)現(xiàn)人類組織/器官轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組的全面對(duì)接;發(fā)現(xiàn)一批針對(duì)肝臟疾病、惡性腫瘤等重大疾病的生物標(biāo)志物、潛在藥靶和蛋白質(zhì)藥物……

      2014年,經(jīng)過(guò)多年論證的中國(guó)人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃在京啟動(dòng),將分三個(gè)階段展開(kāi)。階段,全面揭示肝癌、肺癌、白血病、腎病等疾病所涉及的主要組織器官的蛋白質(zhì)組,了解疾病發(fā)生過(guò)程中蛋白質(zhì)組的主要異常改變,進(jìn)而研制診斷試劑、篩選藥物,力爭(zhēng)2018年底完成;第二階段,爭(zhēng)取覆蓋中國(guó)人的其他常見(jiàn)疾病,提升中國(guó)人群疾病的防治水平;第三階段,實(shí)現(xiàn)人類更多疾病的覆蓋。

      “沒(méi)有人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃這一大科學(xué)計(jì)劃的開(kāi)展,就沒(méi)有現(xiàn)在蛋白質(zhì)組學(xué)的蓬勃發(fā)展和后續(xù)人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的實(shí)施,也就沒(méi)有我國(guó)在該領(lǐng)域的影響力和主導(dǎo)地位。”賀福初表示,十多年間科研團(tuán)隊(duì)積累的技術(shù)、經(jīng)驗(yàn)、人才等,都是如今開(kāi)展人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的寶貴財(cái)富。(生物谷)

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